极小部分脑卒中是一些单基因遗传，如伴皮质下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病，特定的罕见单基因遗传病可能导致家族综合征。
绝大部分脑卒中是由多基因遗传因素和环境因素共同作用导致的复杂疾病，遗传风险因素可以导致脑卒中风险的增加。目前已知的大部分相关基因除直接影响脑卒中的发病外，还通过影响脑卒中和动脉粥样硬化的危险因素间接地起作用。
引起脑卒中的病因有很多，遗传因素在脑卒中的发病及其病因学类型方面起重要作用。高脂血症、糖尿病、高血压、吸烟等危险因素也会增加脑卒中的发病率。因此，对有高遗传风险者倡导健康的生活方式，积极治疗基础疾病至关重要。
