腺瘤性肠息肉应该根据病变大小、性质的不同，选择合理的方法治疗。
腺瘤性肠息肉有恶变的可能性，所以应该及时治疗。息肉比较小的情况下，可以进行肠镜电切除。比较大的扁平息肉，可以进行黏膜剥除术。如果息肉的直径超过了2厘米，且范围比较大，经过仔细评估后可以在肠镜下切除。
尽管腺瘤性肠息肉好发于直肠、乙状结肠等部位，但是也应该探查整个结肠。息肉切除以后应该留置肿瘤组织进行病理切片检查，通过病理检查可以明确是良性还是恶性息肉。如果是恶性，还需要进行化疗、放疗等联合治疗。
