对于比较大的肾结石，如大于2cm的肾结石，造成尿路梗阻、肾脏积水，或者反复血尿的，需要进行手术处理。手术方法较多，比如经皮肾镜取石术取石、输尿管软镜碎石。随着泌尿外科手术器械的发展，临床处理肾结石大多选用微创的方法。
肾结石患者大多无临床症状，可能于体检时发现，或处理其他疾病时，经肾脏彩超检查发现。一般对于比较小的肾结石，如直径小于1cm的，未造成明显梗阻，则可进行观察，待结石排至输尿管后，再对其进行处理。
对于肾结石患者检查以后，应如何进行处理、复查等，需遵循泌尿外科医生的建议。
